Prvé zmienky o hrade pochádzajú z roku 1271. V minulosti plnil strážnu funkciu hranice Rakúsko - Uhorska. V 17. Storočí ho zdedil do opatery Pavol Pálffy, vzdelaný a rozhľadený šľachtic, ktorý dosiahol hodnosť uhorského palatína. V štyridsiatych rokoch 17. storočia dal Pajštún veľkoryso prestavať keď práce zveril najvýznamnejším talianskym fortifikačným staviteľom a umelcom, ktorí pôsobili v habsburskej monarchii.
Pálffyovci tam sídlili až do doby keď sa nepresťahovali do pohodlnejšieho renesančného kaštieľa v Stupave a hrad začal pomaly upadať. Osudným mu však boli až Napoleonské vojská, ktoré odstrelili viaceré hradné múry. Poslednými šľachtickými vlastníkmi Pajštúnskeho hradu boli do roku 1945 Károlyiovci. Hrad je voľne prístupný verejnosti.
V súčasnosti vás pred vstupom privítajú kamenné levie hlavy. Pôvodne ich bolo deväť, dnes už však môžeme vidieť len šesť týchto architektonických skvostov. Jedného dokonca zblízka, keďže padol a nachádza sa neďaleko vstupnej brány. Ak si všimnete pajštúnske levy pozorne, zistíte, že každý z nich má iný výraz tváre.
Zaujímavosť:
Pajštúnsky hrad je veľmi obľúbenou lokalitou s množstvom horolezeckých ciest. Kedysi sa na Pajštúne pripravovalo na hory, v súčasnosti je táto skalka populárna najmä ako víkendová destinácia. Je pomerne dobre odistená (autori istení sú známi), cesty majú dĺžku 25-30 metrov a sú vedené nahusto. Ich počet je cca. sedemdesiat a zalezie si tu naozaj každý. Je tu dostatok ľahších ciest, ale aj tých náročnejších.
